・2009年に高校の先輩である真弓明信が阪神監督に就任すると、その下で久保は一軍投手コーチとして投手起用の采配を揮った。悩んでいた能見篤史をエースとして覚醒させ、ランディ・メッセンジャーが中継ぎとして結果を残せずに退団の可能性もあった中で先発として起用するなど手腕を発揮した[11]。

・2013年に二軍チーフ投手コーチ就任[13]。福原忍・安藤優也・高宮和也・桑原謙太朗などベテランリリーフの改造に手腕を発揮。

・2018年から福岡ソフトバンクホークスの二軍投手コーチに就任[15]。伸び悩んでいた高橋純平、育成入団の大竹耕太郎を飛躍させた。
2020年も岩嵜翔の投球を見直すことで終盤戦の復活につなげた[7]。